1、净水技术不同
纯水机是通过有着超细精度的RO膜反渗透的方式截流住水中的一切有机污染物和无机离子，有一定的废水量，出水为直饮的纯净水。而净水机是通过过滤和吸附的物理方式去除城市自来水中的氯气和因二次污染所产生的细菌病毒、胶体、铁锈、杂质等各种对人体有害的有机污染物。
2、使用功能不同
纯水机以自来水作为水源，家用纯水机精致小巧一般安装于厨房，并配有纯净水专用龙头，直接饮用时还能解决炒菜等用水问题，但每日制水量少，只能解决饮用和做饭。而净水机能够过滤掉自来水氯、杂质等，保留了自来水中的对人体有用的矿物质，却对重金属和水碱的作用不是很大，所以还是没有达到直接饮用的目的。
3、使用装置不同
纯水机有电机，需要电源，有储水罐，一般为五级过滤，主要用于改善口感。可加第六级放置麦饭石。而净水机没有电机和储水罐，不需要电源，靠水压驱动过滤。比较好的为五级过滤，主要用于改善口感。
4、净化后水质不同
纯水机出来的水相当于外面卖的瓶装的纯净水，如果加上麦饭石，大致相当于卖的矿泉水；至于净水机，出来的水是有自来水中矿物质的可以生饮的净化水，他们的主要区别在于是否能够过虑掉水中的有害矿物质。
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